国旗头像是否违法需根据具体情况分析。
1、单纯用国旗做头像并不违法。
2、如果出现以下这几种使用情形则属于违法：

（1）注意看微信头像和微信账号是否本身含有不合法的、侮辱性等内容，根据《中华人民共和国国旗法》第十九条相关规定，如果将国旗图案贴在淫秽、色情或其他侮辱性图片及字眼上，这种行为已经涉嫌违法；
（2）有些微商的头像是其售卖的产品，如果在产品图上加上国旗，就会违反国旗不能用作商标和商业广告的规定，涉嫌违法。我国国旗法规定，国旗及其图案不得用作商标和广告，不得用于私人丧事活动。
广告法规定，广告不得使用或者变相使用中华人民共和国的国旗、国歌、国徽，军旗、军歌、军徽。将国旗图案印在菜品上属于商用。此外，将国旗图案印在包包上进行售卖，将国旗制成衣服等也属于违法行为。
（3）使用国旗作微信头像需要注意保持国旗的完整性，不得涂划、玷污等。

使用国旗时的注意事项
1、悬挂国旗要符合国旗法的规定。
根据《国旗法》相关规定，国庆节、国际劳动节、元旦和春节，各级国家机关和各人民团体应升挂国旗；企业事业组织，村民委员会、居民委员会，城镇居民院（楼）及广场、公园等公共活动场所，有条件的可升挂国旗。
同时，还要按规定早上升起，晚上降下。不得升挂破损、污损、褪色或不合规格的国旗。同时，国旗与其他旗帜同时升挂时，应当将国旗置于中心、较高或者突出的位置。
2、不得升挂或者使用破损、污损、褪色或者不合规格的国旗，不得倒挂、倒插或者以其他有损国旗尊严的方式升挂、使用国旗。不得随意丢弃国旗。破损、污损、褪色或者不合规格的国旗应当按照国家有关规定收回、处置。大型群众性活动结束后，活动主办方应当收回或者妥善处置活动现场使用的国旗。
3、国旗应当作为爱国主义教育的重要内容。学校应当教育学生了解国旗的历史和精神内涵、遵守国旗升挂使用规范和升旗仪式礼仪。
新闻媒体应当积极宣传国旗知识，引导公民和组织正确使用国旗及其图案。
违法使用国旗的法律后果：
1、在公共场合故意以焚烧、毁损、涂划、玷污、践踏等方式侮辱中华人民共和国国旗的，依法追究刑事责任；情节较轻的，由公安机关处以十五日以下拘留。
2、在公共场合，故意以焚烧、毁损、涂划、玷污、践踏等方式侮辱中华人民共和国国旗、国徽的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
【法律依据】
《国旗法》第二十条，国旗及其图案不得用作商标、授予专利权的外观设计和商业广告，不得用于私人丧事活动等不适宜的情形。