非法经营流水1000万的涉嫌构成非法经营罪属于情节特别严重的情形，可处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或没收财产。
非法经营罪的处罚有：
1、犯非法经营罪的，处5年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得1倍以上5倍以下的罚金。
2、情节特别严重的，处5年以上有期徒刑，并处违法所得1倍以上5倍以下罚金或者没收财产。
认定非法经营罪的数额标准是：
1、个人非法经营数额在5万元以上，或者违法所得数额在1万元以上，应当予以追诉；
2、单位非法经营数额在50万元以上，或者违法所得数额在10万元以上的，应当予以追诉；
3、经营数额在十五万元至三十万元以上的；违法所得数额在五万元至十万元以上的等，为“情节特别严重”。
非法经营罪名的构成要件有：
1、主观要件，本罪在主观方面由故意构成，并且具有谋取非法利润的目的，这是本罪在主观方面应具有的两个主要内容。
2、主体要件，本罪的主体是一般主体，即一切达到刑事责任年龄，具有刑事责任能力的自然人。依法成立、具有责任能力的单位也可以成为本罪的主体。
3、客体要件，本罪侵犯的客体是国家限制买卖物品和经营许可证的市场管理制度。
4、客观方面，根据法律规定，本罪主要有以下几种行为方式：
（1）未经许可经营法律、《行政法》中所规定的专营、专卖物品或其他限制性买卖的物品。
（2）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、法规规定的经营许可证或者批准证件。
（3）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为，如非法从事传销活动，倒卖国家禁止或限制进口的废弃物，垄断货源、哄抬物价等等。
【法律依据】
《刑法》第二百二十五条，违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：
（一）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
（四）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。