首次感染单纯疱疹病毒,隐藏期2~10天。好发于男性包皮、龟头、冠狀溝、男性生殖器,偶可见于尿道、前列腺和精囊,同性戀者可发生于肛部、直肠;女性则多见于外阴、大小阴唇、陰蒂、女性生殖道、宫颈,也可发生于肛部、直肠及尿道。感染初期症状较重,皮损为簇集或散在的小水疱,可自行破溃形成糜烂或溃疡,后结痂自愈,疼痛明显,患者常伴有腹股沟淋巴肿痛、发热、头痛、乏力等全身症状。病程约不间断2~3周。
常发生于原发性生殖器疱疹后1~4个月内,第1次被传染后1年内约60%的患者复发,可复发4~6次,有些多达10次以上。复发性生殖器疱疹的症状,比原发性生殖器疱疹轻,病程短,发疹前常有局部烧灼感、针刺感、感觉异常等前驱症状。男性同性戀者可累及肛部、直肠,表现为局部疼痛、便秘、里急后重、肛周溃疡等。
生殖器疱疹疼痛经常在首次发生时最严重,在后面的发作中疼痛将会减轻并且不间断时间缩短。生殖器疱疹的常见的症状可以感染身体的以下区域:男性生殖器、阴囊、外阴、女性生殖道、肛部、尿道、大腿、臀部。然而,有些携带生殖器疱疹的人没有症状,或者是被误诊成其他疾病,比如:女性生殖道酵母菌感染、股癣、虫咬、痔疮、向内生毛。