埃及血吸虫雄虫长为10~15mm,最宽处为0.8~1mm,体表被有小结节。睾丸4~5个,位于腹吸盘之后,前后排列,输精管末端膨大成贮精囊。两肠支在体中部会合成单干盲管,延伸至末端。雌虫长约20mm,最宽处0.25mm,呈细长管形,两吸盘均细小,体表只前后两端有小结节。卵巢在体中部之后,长椭圆形;其他生殖器官位置关系均如日本血吸虫;子宫内含卵20~30个。消化道似雄虫。卵大小为(131~183)µm×(40~70)µm,具端刺。卵壳抗酸染色阴性,而其他血吸虫卵壳则抗酸染色阳性。成虫寄生于人体的膀胱和盆腔静脉丛,偶亦可寄生于门脉系统。雌虫每天产卵200~500个。成虫在人体存活时间为3~6年,个别可活30年(平均3.4年),一对成虫一生中产卵25万个至60万个不等。