银杏树的主要分布在山东，江苏，四川，河北，湖北，河南等地。全国最大的银杏培育基地是山东省郯城县。在山东日照浮来山的定林寺内有一棵大银杏树，相传是商代种植的，已有3500多年历史了。 野生状态的银杏残存于中国江苏徐州北部（邳州市）山东南部临沂（郯城县）地区浙江西部山区。
浙江天目山，湖北省安陆市、大别山、神农架等地都有野生、半野生状态的银杏群落。 在中国的银杏主要分布温带和亚热带气候气候区内，边缘分布“北达辽宁省沈阳,南至广东省的广州，东南至台湾省的南投,西抵西藏自治区的昌都,东到浙江省的舟山普陀岛”，跨越北纬2l°30′-41°46′，东经97°-125°，遍及22个省〈自治区〉和3个直辖市。
中国的银杏资源主要分布在山东、浙江、安徽、福建、江西、河北、河南、湖北、江苏，湖南、四川、贵州、广西、广东等省的60多个县市。从资源分布量来看，以山东、浙江、江西、安徽、广西、湖北、四川、江苏、贵州等省最多，而各省资源分布也不均衡，主要集中在一些县或市，如江苏的新沂、大丰，邳州、吴县，山东省郯城县新村、泰安市、烟台市，湖北随州的洛阳镇，何店镇花园村，广西的灵川、兴安等。
许多银杏专家考证后认为，浙江天目山、湖北大洪山、神农架等偏僻山区，发现自然繁衍的古银杏群。它们是极其珍贵的文化遗产和自然景观，对周围生态环境的改善和研究生物多样性、确保银杏遗传资源的持续利用，具有重要作用。自然资源考察人员还在湖北和四川的深山谷地发现银杏与水杉、珙桐等孑遗植物相伴而生。
[10] 银杏的垂直分布，也由于所在地区纬度和地貌的不同，分布的海拔高度也不完全一样。总的来说，银杏的垂直分布的跨度比较大，在海拔数米至数十米的东部平原到3000m左右的西南山区均发现有有生长得较好的银杏古树。如江苏泰兴海拔为5m左右、吴县海拔约300m、山东郯城海拔约40m，四川都江堪海拔1600m，甘肃为1500m(兰州)，云南为2000m(昆明)，西藏为3000m(昌都)。
但这些分布现状，并不表明银杏能够分布在这样的垂直跨度内的所有地区，因为影响银杏自然分布的因素除纬度和海拔外，地形和土壤也是很重要的因子，如土壤含水量、含盐量、日照、极温等均直接限制着银杏的发展。在银杏自然分布的边缘地区，可能由于地形等因素，出现利于银杏生长的小气候，银杏仍旧可以生长得很好。
同样在银杏的自然分布区范围内，由于小气候或者地形、土壤、水热条件的差异而有不适合银杏生长的地区，所以在自然分布区范围内，银杏多呈点状分布。从气候因子来看，垂直分布主要集中在年平均气温8℃—20℃，绝对最低气温不低于-20℃的海拔范围内，这是符合银杏的生态习性的。
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