1）口服药物：抗病毒药物：病毒灵，每次口服0.2克，每日3次，1个月为一疗程；或泛昔洛韦，每次0.2克，每日2次，疗程同前。提高免疫力的药物：口服左旋咪唑50毫克，每日3次，服3日停11日。其他：每次服维生素A2.5万单位，每日3次。口服溶菌霉，每次5～7片，每日3次。口服乌洛托品，每次0.3～0.5克，每日3次。
2）注射药物：维生素B12：每次100毫克，每日1次肌注，30天一个疗程。转移因子：皮下注射，每次2毫升，每周2次，30天一个疗程。聚肌胞：肌注，每次2毫克，3日1次，30天一个疗程。也可以皮损内注射，疗效较佳。板蓝根注射液：肌注，每日2次，每次2毫升，注射两个星期为一个疗程，同时用板蓝根30克，煎水熏洗疣发处皮肤，每日2－3次。
3）局部外用药物疗法：5％氟尿嘧啶软膏外涂，次日再用1％金霉素软膏外涂，交替使用，可以去疣。亦可用0.1％维甲酸软膏外涂，或外搽50％雷锁辛溶液，每日2次，直到其消退。如使用上述药膏外涂后，局部皮肤有轻度发红或炎症，不需停药，因为轻度炎症可以促进扁平疣的消退。
4）液氮冷冻或激光治疗：需由皮肤科医生操作治疗。
扁平疣的治疗
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扁平疣的发生以青少年为多见，好发部位为颜面和手背，影响美容。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒引起的。大多数都是突然出现，一般为针头至米粒大或稍大的扁平丘疹，呈圆形或不规则形，略高于皮肤表面，也可显著地突起而形成圆顶状。表面光滑，境界清楚，触之较硬，为浅褐或灰白、淡黄或正常皮色。多数分散存在或密集成群，有的互相融合或沿抓痕呈条状分布。一般无自觉症状，有微痒。好发于颜面、前额和手背，也可发生在腕和膝部。大多对称，数目不定。有时和寻常疣同时存在。可以自愈，亦可复发，愈后不留瘢痕。
扁平疣主要是通过直接接触传染，但是也可通过污染物，如针、刷子、毛巾等间接传染。另外，外伤也是引起传染的重要因素，平时经常可见到扁平疣沿着抓痕分布排列成条索状，这就是外伤可比价格引起传染的一个例子，此外，机体免疫力低下的人也比正常人容易传染到扁平疣。
民间最简单的治疗扁平疣的方法，是用中药鸦胆子仁涂擦疣面；或取薏苡仁30克，水煎服。
对少数分散存在的扁平疣除用鸦胆子仁涂面外，还可加100克蒸馏水配5%的酒石酸锑钾液点涂疣面，至患处发疱时停止，然后散布硼酸滑石粉，促使其干燥结痂，痂脱即愈。如数目较多，也可分批进行。 对于疣发较多的病人，还可用板蓝根30克，煎水熏洗疣发处皮肤，每日2～3次，使用板蓝根注射液进行肌肉注射，每日2次，每次2毫升，注射两个星期为一个疗程，有治疗扁平疣的作用。
其他疗法还有：病毒灵，每次口服0.2克，每日3次，1个月为一疗程；磷酸氯奎，每日3次， 第一次服0.125克，第二、三次服0.25克。用这种方法服1周后，从第二周开始，每次0.25克，每日2次，第三、四周每天只服0.25克，4周为一疗程；还可用维生素B12，每次100毫克，每日1次肌肉注射。一个疗程为30天。
此外，保持健康的心理状态，对治疗扁平疣也十分重要。即使患了扁平疣，也要心情舒畅， 加上有效的中西医结合治疗，一定会使扁平疣得到治愈。
