一、外涂药物
①用10%的碘酒、6%的水杨酸、30%的冰醋酸外涂：可选用上述三种涂液中的任何一种，每日涂病甲1～2次，用药前应先把病甲刮薄。可坚持涂药至新甲长出，一般需治疗3～6个月。(涂药时应避免将药液涂到甲周皮肤上，以免损伤皮肤)。
②用8%的环吡酮胺软膏外涂：每日涂抹病甲2次，可坚持涂药至新甲长出，一般需治疗3-6个月。
③外涂易康达苗语灰甲宁，属于目前杀菌能力比较好的，在新甲的生长过程中，可以为新甲形成很好的抗菌能力。二、内服药物
适用于病甲损害严重、病甲较多和局部用药效果不佳者。
目前，临床医生常推荐用下面的口服抗真菌药物来治疗甲癣：
氟康唑(大扶康)：每日口服150毫克，一般需连续服用3～6个月。
内服药物法的优点是可由内向外地治疗疾病，避免了每天涂药的烦恼，轻松方便，同时口服药还可对于足癣、体癣、股癣、头癣等一并治疗。以上三种药物在我国已上市十多年，临床应用广泛，疗效确定。其中，服用斯皮仁诺胶囊一周后，药物就可直接到达指(趾)甲。停服该药后当患者的血液是几乎没有该药存在时，其指(趾)甲中的药物却会持续存在，这样就大大提高了口服该药的有效性;服药治疗的缺点是花费相对较高，部分患者会出现不良反应，所以，患者最好应在医生的指导下服药，尤其是患有肝脏疾病者及孕妇、哺乳期妇女应避免服用上述药物。三、中药
传统中药治疗灰指甲的方法：
1、棉棒蘸复方土槿皮酊浸渍甲部，每日一次，每次10分钟。用药前用小刀刮除已灰化的指(趾)甲，每隔一周刮除一次。
2、急性子、人工牛黄、川椒共研为细末，白酒调成糊状，并加少许甘油调匀涂患处。
3、白凤仙花捣烂涂甲上，用布包好，每日换一次，直至痊愈。
4、苦参、地肤子、大茴香各等份，以75%乙醇浸泡，取液涂患处，每日s数次。
不过此法效果一般，用不好会损伤皮肤，所以也不建议使用。