依患者病情而定。有些人病情较轻，治疗起来较为容易，费用当然就少。反之，病情较重的患者，则需要多种治疗方式同时进行，这样才能有效控制病情、清除病毒，从而治疗费用也会增多。但是，只要选择国家正规的公立甲等医院，治疗费用会严格执行国家医疗统一收费标准，严格按照地方物价局标准收费，治疗费用一般患者都能承受。
依选择的治疗方式而定。激光治疗、手术治疗、中药治疗等传统诊疗技术往往难以确定HSV亚型分类，只是针对尖锐湿疣病体，在短时间内毁坏病体表面组织，消除病体，却没有彻底清除患者体内的尖锐湿疣病毒，容易复发，多次治疗，费用当然不低，而且造成的伤害也很大。因此，选择一种好的治疗方法，能省去后顾之忧。
