即使急性支架血栓很少发生,但急性血栓可在TIPS术后立即出现或发生在术后很短的时间内。传统的治疗方法是取栓(例如通道血栓切除术)。迟发的通道狭窄或闭塞通常是支架内假内膜增生或实质通道完全阻塞。治疗方法是通道再通。术后1年内通道的开放率为70%,2年的开放率为55%。二期开放率(通道再通后的开放率)超过90%。TIPS手术主要的远期并发症是肝性脑病,发病率为20-%30%。治疗方法通常是控制饮食和服用半乳搪苷果糖。能够增加TIPS术后肝性脑病的危险性的疾病除酗酒、女性、年龄、既往有脑病病史等因素外,还包括肝脏本身病变。