微波灭菌法含菌量高达350万个大肠杆菌的生理盐水混悬液，密封在1－2ml的安瓿中，经3－5千瓦功率，2450兆赫的微波作用15秒钟以上，安瓿温度接近110℃左右时，可将细胞细菌全部杀灭。金黄色葡萄球菌与此结果近似，枯草杆菌芽胞，含量为6万－8万个时，液温必须达到140℃，保持20秒钟以上。才能彻底杀灭，含2，000－3，000个青菌胞子的生理盐水混悬液，在3－4千瓦微波功率作用下，液温达到120℃以上，经20－25秒钟，即彻底杀灭。经过微波灭菌后的安痛定、维生素、维生素C、速尿、庆大霉素、卡那霉素注射液。除维生素C的溶液色泽有部分变黄外，其他五种的色泽、pH和主要成份含量都无明显变化。宇野等还比较了微波灭菌与高蒸气灭菌对17种化学药物稳定的影响，认为对高压蒸气灭菌稳定的药物，使用微波灭菌时无变化，而对高压蒸气灭菌不稳定的药物如维生素C，阿司匹林等用微波灭菌，则比较稳定，其分解程度降低。此法由于存在破损率高，灭菌不完全及劳动保护等问题，还有待进一步研究。医学教育网搜集整理
