十二指肠溃疡的活动期，需要积极的治疗，合理的选用药物，及时促进溃疡愈合，防止病灶进一步扩大和并发症的发生，减少瘢痕形成。临床上选用药物包括抗酸、抗幽门螺杆菌、保护胃黏膜及辅助对症四个方面作用的药物。但不是上述药物一定要同时应用。
(1)活动期的治疗:①应以抗酸为中心，选用强有力的抗酸药，目前最佳的抗酸药有奥美拉唑、兰索拉唑、潘托拉唑等。②选用h2受体拮抗药，如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁、罗沙替丁、尼扎替丁等。这些药物之所以效果好，是它们专门阻断分泌胃酸的壁细胞分泌胃酸，比以往常用的各种中和胃酸药更为有效可靠，因为每人每天分泌胃液1. 5〜2. 5升。要用碱性药片来中和胃酸，就要每天吃一大把的药，而且要服用多次。现在使用的这些药物，每天只服1〜2片就可以达到有效抑制胃酸的作用。
(2)保护胃黏膜的药物：可选硫糖铝、胶态铋剂（德诺等）、前列腺素制剂等。这类药物服后能形成一层保护膜将病灶保护起来，并能促进溃疡愈合或提高胃黏膜的抗病及修复能力。
(3)抗幽门螺杆菌的药物:可选用胶态铋制剂、甲硝唑、阿莫西林、克拉霉素、羟氨苄青霉素等。抗菌药可杀灭或抑制幽门螺杆菌，可以加速溃疡愈合，但更重要的作用是减少溃疡复发。临床上多用胶态铋制剂，因为该药兼有保护胃黏膜和抗菌两种作用。但每个疗程不能超过2个月，以防铋中毒。
(4)辅助对症治疗药：可根据症状酌情选用。例如，有上腹胀满等消化不良症状，可用西沙必利或顺导冲剂、吗丁啉等；失眠可晚睡前用地西泮(安定）片;上腹部疼痛用抗酸药不缓解时，可短期加用解痉药，如山莨菪碱片等，有青光眼、前列腺肥大者禁用此类药。
