纤维内镜虽然柔软可屈,安全性大,但如操作不慎,不严格掌握适应证,则可发生各种并发症,甚至危及生命。主要并发症有:(1)操作不慎,器械直接损伤咽喉、气管、食管或胃肠道,引起血肿、气肿、脓肿、出血和穿孔等。操作还能诱发胃肠道外病变或使之恶化,如心脏(心脏骤停、心肌梗塞、心绞痛、心律紊乱等),肺脏(气胸、吸入性肺炎),脑部(脑血管意外)等并发症。(2)因为个体的敏感性而致机体异常反应,如药物副作用(术前使用阿托品、安定、鲁米那、利多卡因等引起的皮疹,过敏性休克、尿潴留、青光眼发作等副反应)和精神神经性反应(如咽喉、食管及胃肠痉挛,虚脱、晕厥、癔病发作等)。