1.急性发作期
应全身应用抗生素，常用林可霉素静脉滴注，也可选用其他广谱抗生素。
2.非急性期
偶有发作仍可以使用广谱抗生素。对反复急性发作的患者需手术治疗，手术时间应选在两次急性发作的间歇期，术前术后都需使用抗生素。局限性骨脓肿的治疗以手术为主，早期以排除淤积滞留骨脓肿液，防止骨脓肿积液再生，晚期则以手术切除不能复原的病变组织或以分流术治疗局限性骨脓肿阻塞。
3.非手术治疗
（1）体位引流肢体下垂状态使组织间隙中骨脓肿液滞留加重，抬高患肢30～40厘米，利用重力作用可促进骨脓肿液回流，减轻水肿。此法简单有效，但作用不持久，患肢下垂水肿可再度加重。
（2）预防感染选用抗真菌的油膏、扑粉，保持足趾干燥是预防和控制真菌感染最为有效的方法；足趾甲床下细菌感染也较为多见，应勤剪指趾甲，清除污垢，减少细菌入侵途径。当链球菌感染全身性症状时，应选用青霉素等药物，配合卧床休息，积极控制感染。晚期局限性骨脓肿并发皮肤皲裂可采用油膏外敷保护并润滑皮肤。
4.手术治疗
大多数局限性骨脓肿不需外科手术，约15%的原发性局限性骨脓肿最终需行手术，现有手术方法除截肢术外均不能治愈局限性骨脓肿，但可明显改善症状。
（1）手术适应证①肢体功能损害：由于肢体粗重易疲劳和关节活动限制。②过度肿胀伴疼痛。③反复发作的蜂窝织炎和骨脓肿管炎，经内科治疗无效。④骨脓肿管肉瘤：长期局限性骨脓肿恶化，危及生命。⑤美容：大多数原发性局限性骨脓肿患者为年轻妇女，对于肿胀明显并有美容要求者可考虑手术，但应以改善功能为主。
（2）术前准备对手术效果有重要作用，包括：①卧床休息抬高患肢使肢体水肿减少至最低限度。②控制感染对反复发作的急性蜂窝组织炎和急性骨脓肿，应选用敏感药物于术前、术中静脉或肌注给药，减少术后感染机会。③清洗皮肤达到溃疡愈合或控制局部感染的目的。
（3）手术分类局限性骨脓肿手术可分为两类病变组织广泛切除术；病变组织分流术。
（4）术后护理①保持术后引流通畅；分离的粗糙面可有持续渗血，必须放置负压引流；②术后继续抬高患肢，减轻患肢水肿，有利于静脉及骨脓肿回流。
