是由遗传基因本身决定的，一般分蓝色与褐色两种，并且褐色，也就是我们黄种人虹膜颜色，对白种人的蓝色是显性的，也就是说同时具有“褐色”与“蓝色”两个基因的个体呈现褐色虹膜，只有纯合子(两个都是“蓝色”基因)才是蓝色的，欧州多是蓝色，那是因为他们大体上说起来还是以本人种通婚为主，因此多是纯合子。结构引人而异，已被开发成类似于指纹识别的个体识别标志之一。
虹膜颜色会因为人种的不同而深浅不一,而在东方人一般均为深棕色,若有颜色异常必须怀疑是一些全身性的疾病;像恶性贫血、铜代谢等.决定眼珠颜色的是虹膜组织里所含有色素的量.而虹膜就是角膜后面瞳孔外围的一层环状薄膜,而瞳孔正是这层薄膜中央的一个圆孔.在虹膜组织里,含有两种不同的棕色色素
