小肠结肠炎耶尔森菌此菌可经口、鼻腔吸入下呼吸道，引起原发性肺炎，但大多数是先进入消化道，引起回肠末端小肠黏膜下淋巴组织集结溃疡形成，肠系膜腺体炎和门脉菌血症，细菌可通过全身进入肺内，尤其是肝硬化病人，易发生败血症。细菌毒力包括V、W 膜抗原，温度敏感钙依赖性因子和内毒素。耶尔森菌有很多血清型，根据毒力可分为两大类：A、致病力B、无致病力 大部分血清型属于无致病力。小肠结肠炎耶尔森菌侵袭力较强，在本菌属中最易引起人类疾病。该菌主要侵入途径为消化道，尤其在胃酸缺乏时可顺利进入肠道，常粘附于回肠末端、盲肠及结肠粘膜，并可从下层组织进入到淋巴结，在淋巴组织中长期存活和生长，引起淋巴结炎。由于炎症反应引起下腹部疼痛，这种典型的症状可能会误诊为阑尾炎。对小肠结肠炎耶尔森菌肠炎的早期病例进行组织学研究，表明小肠淋巴结及Peyer受累，有小脓肿形成。因误诊阑尾炎而手术的病人常发现肠系膜淋巴结炎，有或无末端回肠炎。该菌的显著特点是既能侵入肠粘膜上皮细胞，又能产生一种或数种肠毒素，导致腹泻。在机体抵抗力低下时，肠毒素可进入血流，发展成败血症，全身各系统及脏器均可发生化脓性损害。耶尔森菌的组织侵入性与分子量为42.2±1.1MDa大小的质粒有关，称为毒力质粒。小肠结肠炎耶尔森菌血清型O:3、O:8及O:9同Hela细胞及猪肾细小肠结肠炎耶尔森菌肺炎X线图胞做Sereny试验，证明其具有侵袭性，这种侵袭性由质粒介导。因此认为小肠结肠炎耶尔森菌的致病性主要是有质粒介导的侵袭力所致，而不是毒素。小肠结肠炎耶尔森菌所特有的超抗原可诱发肠外症状，如关节炎、结节性红斑、甲状腺疾病以及败血症等。有组织相容性抗原HLA-B27的病人常发生变态反应性病变，如多发性关节炎等。小肠结肠炎耶尔森菌另一特点与体内铁有关，，由于小肠结肠炎耶尔森菌铁载体的作用，铁含量增加则可增加易感性，铁的供应和外源性含铁细胞将促进肠道外小肠结肠炎耶尔森菌感染的发展。小肠结肠炎耶尔森菌致病机理至今尚不完全清楚，可能与外膜蛋白、肠毒素、毒性质粒、超抗原、铁摄取系统等有关。
