如临床高度怀疑或已确诊的患者,应及早停用有关抗生素,加强支持疗法,纠正水、电解质紊乱,避免使用止泻药或抗胃肠蠕动药物。因绝大部分PME由难辨梭状芽孢杆菌所致,应针对细菌采取治疗措施。(1) 抗感染治疗:临床常用万古霉素、甲硝唑、杆菌肽等。(2) 吸附致病菌:难辨梭状芽孢杆菌毒素常用考来烯胺每次4 mg,每日4次,7〜14日,适用于中度病情或复发者;污泥梭状芽胞杆菌抗毒素可中和难辨梭状芽孢杆菌毒素,每次5万U静脉滴注,每日2次。(3) 替换大便菌丛:以正常大便悬液保留灌肠,能抑制难辨梭状芽孢杆菌。还可用乳酸杆菌制剂每次1 g,每日4次,用7〜14日。(4) 对于多次复发的患者的治疗:在用万古霉素或甲硝唑口服7〜14日控制症状后,在随后的3周内应再予以下述的一种药物以促进控制疾病并建立正常的菌丛,可选择的药物有:考来烯胺每次4mg,每日4次口服,用药3周或乳酸杆菌制剂每次1 g,4次/日,口服,用药3周或万古霉素125 mg,口服,隔天一次,用药3周。(5) 对于暴发性或症状顽固者及并发急腹症者:如中毒性巨结肠、结肠穿孔应外科手术治疗。