对于医Y产生的大量污染性污水，在医疗系统中也要求有针对性方法进行收集和集中处理。此外，污水处理系统需要信息化。主要是指信息化技术在污水处理设备中的应用，即通过将先进的信息技术引用到设备当中，进行一系列的设备处理分析，达到资源整合的作用。信息化污水处理系统具有事故分析、自动检测等多种自动控制功能，可以实现污水处理设备统一化管理及资源调控与维修。医Y污水处理系统分为常规污水处理和特殊性质污水处理。常规处理通常由格栅、预消毒池、化粪池、调节池、脱氯池、初沉池等设施根据水质及处理要求组合而成。仅对污水中肉眼可见的不溶物、大颗粒有机物做简单分离处理。
水污染指标是衡量水体被污染程度的数值标示，也是控制好检测水处理设备运行状态的重要依据。其中，最常用的水污染指标有(8个)：生化需氧量(BOD)：表示在有饱和氧条件下，好氧微生物在20℃,经一定天数降解每升水中有机物所消耗的游离氧的量，常用单位mg/L，常以5日为测定BOD的标准时间，以BOD5表示。
化学需氧量(COD)：表示用强氧化剂把有机物氧化为H2O和CO2所消耗的相当氧量。常用的氧化剂为重铬酸钾或高锰酸J，分别表示为CODCr或简写(COD)和CODMn(也称耗氧量，简称OC)，单位为mg/L。总需氧量(TOD)：当有机物完全被氧化时，C、H、N、S分别被氧化为CO2、H2O、NO、SO2时所消耗的氧量，单位为mg/L。
总有机碳(TOC)：表示水中有机污染物的总含碳量，以碳含量表示，单位为mg/L。悬浮物(SS)：水样过滤后，滤膜或滤纸上截留下来的物质，单位为mg/L。pH：表示污水的酸碱性。有毒物质：表示水中所含对生物有害物质的含量，如氰H物、砷化W、汞、镉、铬、铅等，单位为mg/L。
大肠杆菌数：指每升水中所含大肠杆菌的数目，单位为个/L。
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