全部加工贸易合同的签订流程是：合同主体先进行协商，就合同相关内容达成一致一致意见，签订合同；申请人向海关递交材料，海关受理后进行初审；海关审核企业的加工贸易合同和各项资料是否符合国家和海关的有关规定；相关企业需到中国银行设立银行保证金台账；核发手册。
法律依据：
《民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第四百六十九条
当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。
书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。
以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。
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