按 1999 年 WHO 分类标准:
A 型胸腺瘤:即髓质型或梭型细胞胸腺瘤。
AB 型胸腺瘤:即上皮细胞、淋巴细胞混合型胸腺瘤。
B 型胸腺瘤:被分为 3 个亚型;B1 型胸腺瘤:即富含淋巴细胞的胸腺瘤、淋巴细胞型胸腺瘤、皮质为主型胸腺瘤或类器官胸腺瘤;B2 型胸腺瘤:即皮质型胸腺瘤;B3 型胸腺瘤:即上皮型、非典型、类鳞状上皮胸腺瘤或分化好的胸腺癌。
C 型胸腺瘤:即胸腺癌,组织学上此型较其他类型的胸腺瘤更具有恶性特征。A 型和 AB 型为良性,B 型和 C 型为恶性。简化分类:胸腺瘤(A、AB、B1、B2)、不典型胸腺瘤(B3)、胸腺癌(C)
这一组织学分类更多的应用于临床,在治疗模式的选择上起着指导性的作用。