乙脑是一种人畜共患的自然疫源性疾病。与人关系密切的猪、牛、马、羊、鸡、鸭等畜禽，均可因被蚊虫叮咬而感染乙脑。同时它们也是乙脑的传染源，即蚊子叮咬了这些有病的动物后再叮人，就可将乙脑传染给人类。通常乙脑在人群中流行的前几周，已通过蚊子→畜禽→蚊子的循环而广泛传播。因此，畜禽是乙脑的主要传染源。当人体被带有乙脑病毒的蚊子叮咬后，病毒就随着蚊子的唾液进入人体，经4-21天的潜伏期后，先在人体被咬处的细胞中生长繁殖，之后经血液到淋巴结等网状内皮系统中大量繁殖，然后再回到血液中形成病毒血症。人类感染乙脑后仅有较短的(约1周)的病毒血症期，而且血中的病毒含量也少，因而人类的乙脑患者不是乙脑的主要传染源。
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