1、目的不同。科学的目的是求真，伪科学的目得是求利。
2、起点不同。科学活动立足已有的历经反复实践证明是正确的科学知识、科学原理、科学方法和现实的物质技术基础。因此，科学的基础是客观实实在在的、稳固的。伪科学的起点是纷繁复杂、五花八门。但有一点是共同的，那就是彻头彻尾的主观、唯一心。
  
3、路径不同。科学研究、科学探索严格遵循着假设、求证、再假设、再求证的路径深入进行，一般都要经过多次，甚至数十次，数百次的的反复才能取得成果。伪科学是最怕求证，最怕检验，当然不会走科学研究的路径，他们走的是一种设招、演招、吹招的路径。
4、心态不同。
  科学研究，特别是基础研究，一般比较枯燥、寂寞、艰辛；偏离喧嚣的功利场,又需要极端的认真、严肃、一丝不苟。这种工作特点决定了科学家们的心态必须是纯正的、甘于寂寞、肯于奉献、勇于进取、讲究实际又坚持真理。伪科学的心态则无比的丑陋、猥鄙。他们贪婪，存心玩弄骗术，却又要挂出冠冕堂皇的招牌；他们追功逐利，哗众取宠，却又要给人超凡脱俗、救苦救难的假象；他们拒绝科学的验证，却又不肯收起骗人的的花招，更不愿反戈一击，澄清真相；他们贼喊捉贼，倒打一耙，指责科学家对他们不宽容，当他们被科学驳得体无完肤、走投无路的时候，又用沉默继续与科学对抗，以图等待时机，东山再起。
  
5、结果不同，科学探索和其他科学生活动的最终成果表现在两个方面： 一是产生经得起检验的科学成果。只要有同等条件，这成果必能重复的产生；只要在有效的范围里，相关的科学成果必能百分之百的使用。二是产生良好的社会效应。现代文明社会里，衣食住行哪一样不是科学的结晶、科学的恩惠呢？当今时代尽管科学已有很大发展，但还有许多的谜没有破解，这不是科学无能，也不是科学的局限，而正是说明了科学发展的还很不够。
  科学的空白只能由科学自己来开拓、来填充，他不会成为伪科学存在的理由。伪科学的结果必然十分可悲，亦可恨。可悲的是伪科学终将破产，因为他们是假的，无论如何伪装、隐蔽，也终究会被科学暴露在光天化日下，终究会被破产；可恨的是伪科学会给社会造成不可低估的危害，愚弄人民，搞乱人们的思想，给国家和个人财产造成损失，使个人身心受到损害，甚至酿出命案。
  
。