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阅微基因微生物基因组学研究/转录组学研究/真核基因组测序/宏基因组学研究/微生物分子生态学?

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阅微基因微生物基因组学研究/转录组学研究/真核基因组测序/宏基因组学研究/微生物分子生态学?


        

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    2018-10-18 01:26:26
  •   转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有RNA的总和。基于新一代高通量测序技术的转录组测序能够全面快速获得样本的几乎所有转录本,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。 微生物基因组学研究是生物体基因组学研究的重要分支,通过基因组学的研究可了解微生物各种代谢过程、遗传机制和生命活动所需要的基本条件以及微生物特殊功能如致病性的遗传基础等。
       真核基因组测序(de novo sequencing)不需要任何参考序列可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法对测序序列进行拼接组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。通过基因组测序是快速了解物种的重要途径,可加深对所测物种生长、发育、进化、起源等重大问题的认识。
       宏基因组(Metagenome),即特定小生境(如土壤,海洋,肠道等)中全部微小生物遗传物质的总和,目前主要指环境样品中细菌和真菌的基因组总和。宏基因组学(Metagenomics)技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。
      
       微生物分子生态学是利用分子生物学手段研究自然界微生物与生物及非生物环境之间相互关系及其相互作用规律的科学,其研究方法包括PCR克隆文库、Geochip芯片分析和第二代高通量测序等。其中第二代高通量测序技术(尤其是Roche 454 GS FLX平台)对16s/18s rRNA/DNA高可变区进行测序,可快速对各种环境的微生物种群结构进行分析。

    杨采丹

    2018-10-18 01:26:26

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