大多数女性性交后的腹痛都是生理性的。性交时男性阴茎抽动，会对女性阴道、腹腔及盆腔器官产生剧烈刺激，在性高潮时会出现阴道及盆腔器官充血，组织发生收缩或痉挛，引起腹痛。性兴奋可能会掩盖腹痛，在性交后腹痛就会变得明显。这种情况比较常见，通常可以忍受，并且过一段时间疼痛会自行消除。 另一类引起腹痛的常见情况是性交性膀胱炎，也称为蜜月膀胱炎，是由于尿道在性生活中受机械刺激所造成的。这种情况下，改变性交的体位，减少对阴道前壁的压迫，以及在性生活后马上排空膀胱，都有助于减轻症状。
性交疼痛(出血)和性交不能是两组常见的症状，前者指性交时伴有疼痛或出血，后者意味着阴茎未被允许或不能插入前庭和进入阴道，性交疼痛严重时往往出现性交不能。狭义的性交疼痛是指在没有器质性病患存在的情况下，由于性交时阴茎向阴道内的插入或在阴道内的抽动，或在性交之后所出现的阴道局部或下腹部的轻重程度不等的疼痛。
从广义来说，性交疼痛也包括各种器质性原因所致者在内，如盆腔器官的某些局部因素或各种全身性疾病的局部影响。造成性交不能或性交疼痛的女方原因包括性无知或缺乏经验，也包括多种心理、社会因素和生理因素，以及各种因素的交互作用。然而，不论问题的起因如何复杂和变化多端，但它们造成的最终结果却是相似的，人们发现很难以单一的因素来解释这一主诉，特别是病程较为持久时。
与其他性问题相似的是问题也可能出自男方，如阴茎严重畸形造成的性交疼痛，或男子在女方阴道尚未润滑就粗暴地插入。性交疼痛若是原发性的，系指婚后性生活刚开始时症状即存在，多意味着存在某种解剖缺陷或顽固的心理因素；而继发性性交疼痛者，曾有过美满的性生活，后因种种因素出现性交疼痛。
完全性性交疼痛指的是在任何场合下疼痛均持续存在，往往有器质性因素的影响，而境遇性性交疼痛系指在某些情境下出现疼痛，而在某些情况下却若无其事，一切正常，显然多因心理因素所致。表浅性性交疼痛只发生在阴道入口处，而深部疼痛则只在插入很深或抽动过于激烈时才出现。
若性交疼痛仅在性交之后数小时才出现，则多为心理因素在作怪。性交疼痛的特点是经常伴有下腹部疼痛，疼痛剧烈且反复发作，往往性交后数小时才消退，有时不得不拒绝性交，从而为双方的性关系和婚姻关系蒙上阴影。它与新婚初次性交时处女膜破裂造成的暂时性疼痛不同，也与很多妇女有时可能出现的性交不适不同，不应混淆。
从性生理观点来看，由于人们对性唤起阴道分泌润滑液的这种生理现象有了深入了解，所以能够理解阴道润滑不足对性生活的重要影响。如药物影响这种分泌时就会造成插入或抽动时的灼痛，典型的药物是抗组织胺药物吩噻嗪。其他造成阴道润滑不足的问题包括干燥综合征、糖尿病、阴道炎（特别是萎缩性、化学性或放射性所致），及种种心理因素。
萎缩性阴道炎可造成阴道外部、内部或插入时的锐痛或轻度疼痛，多见于绝经后、垂体功能低下，尿毒症及未经治疗的特纳氏综合征等雌激素缺乏的境况。 由于人们观察到性兴奋期和平台期阴道内２／３段的扩张，以及子宫和阴道顶端的升高，因此，对影响这种扩张和升高的器质性因素所致的阴道深部性交疼痛的发病机制有了新的认识，也就容易采取一些措施来防止性交疼痛的发生。
如子宫后倾、卵巢脱垂或囊肿、子宫内膜炎、盆腔炎等慢性感染或子宫内膜异位症或手术后等造成的盆腔内软组织的粘连，它们均可造成阴茎深插入或抽动可以加剧的深部疼痛。
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