甲功三项是检查甲状腺分泌功能的良好指标。项目是T3，是三点甲状腺原氨酸，T4是甲状腺素，TSH是促甲状腺激素。另外，还应该检查游离T3、T4。甲功三项是反映甲状腺生理功能状态的指标，其中TSH是垂体分泌的促甲状腺激素，FT3、FT4是甲状腺自身分泌的激素。
如果出现TSH下降，而FT3、FT4升高，属于临床上最常见的甲状腺功能亢進（简称甲亢）类型，病因可能是Graves病、桥本氏病、亚急性甲状腺炎、甲状腺高功能腺瘤等，需进一步确诊后选择不同的治疗方式。
如果TSH升高，而FT3、FT4下降，属于临床上最常见的原发性甲状腺功能减退（简称甲减）类型，甲状腺切除术后、放射线毁坏、桥本氏病等都可引起，一般来说都需要甲状腺激素替代治疗。
如果三项指标都下降，是因为垂体分泌的促甲状腺激素减小，导致甲状腺分泌的FT3、FT4也少，一般见于产后大流血导致脑垂体供血不足、坏死所致的席汉氏综合征，还可见于垂体除TSH之外的肿瘤导致TSH轴受损引发的甲减。
如果出现TSH、FT3、FT4三项指标都升高的情况，是因为垂体分泌的促甲状腺激素增高，导致甲状腺分泌的FT3、FT4也高，提示垂体性甲亢，可能是垂体TSH肿瘤或下丘脑TRH肿瘤，不过这种情况在临床上很少见。
如果TSH正常或偏高（一般<10），FT3低，而FT4正常或偏低，属于低T3（T4）综合征，提示体内正处于高消耗状态，如肝硬化、肿瘤患者，甲状腺自我保护，减小FT3向FT4转化，以减小机体消耗。值得提醒的是，这种情况不是甲减，必须鉴别清楚。
如果TSH升高，但FT3、FT4正常，提示亚临床甲状腺功能减退；相反，如果TSH下降，但FT3、FT4正常，提示亚临床甲状腺功能甲亢。出现这种情况需要进一步监测甲状腺功能及甲状腺分泌的其他激素及机体其他检验项目以决定是否需要治疗
