目前治疗分一般性治疗、抗病毒治疗，这些治疗都是必要的。一般性治疗事实上是对症治疗，而抗病毒治疗是对因治疗，
(1)一般疗法
①主要是保持局部清洁、干燥及疱壁完整。可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神安慰。
②并发细菌感染者，可外用抗生素药膏。
③局部疼痛明显者，可用5%盐酸利多卡因软膏或口服止痛药。
④精神安慰，说明复发的原因和如何治疗及处理。
⑤女性复发性生殖器疱疹须作妇科检查以除外子宫颈癌。
(2)疣苗治疗（抗病毒治疗）：
肌注纯化疫苗，16支为一疗程，前四周每周两支/两次，以后每周注射一支。（关于纯化疫苗的介绍请点击“疣苗疗法”）
（3）家庭自疗：
①半枝莲适量,捣烂敷于患处,每日2次。
②马齿苋适量,捣成茸状,外敷患处,每日换药1次。
③新鲜无花果叶数片,洗净捣烂,加食醋适量,调匀成稀泥状,敷于患处,干则更换。
④生大黄、黄连、黄柏各30克,乳香、没药各15克。共研为细末,用时以麻油调成糊状,涂于疮面上,每日1次。
对于生殖器疱疹的患者，必要的忌口是防止复发的必要条件。如常吃辛辣发物，抽烟饮酒都对康复不利，特别是饮酒可促使本病复发，加重本病的症状，所以，患病后一定不要饮酒。多吃富含维生素、蛋白质的食物有助于疾病的康复，如新鲜的蔬菜、水果及牛奶、鸡蛋等。
（4）有一些食疗方有助于生殖器疱疹的康复
(1)薏仁粥(《本草纲目》)
组成 薏苡仁60g
用法 加水适量，煮粥，加入白糖适量食用，每日1次。
适应证 用于阴部疱疹缓解期，具有健脾利湿、清热解毒之效，长期应用可减少复发。
(2)苦瓜饮(《福建中草药》)
组成 鲜苦瓜适量。
用法 绞汁1杯，开水冲服。
适应证 本饮具有清热解毒利湿之功，可用于阴部疱疹中医辨证属于毒热夹湿者。
