尖锐湿疣最佳的治疗时间，是在尖锐湿疣发病的初期，因为在这个时候，尖锐湿疣的症状是比较突出的，这些症状表现，都是尖锐湿疣患者判断病情的主要依据。也是尖锐湿疣患者，能够在发病的早期，及时发现病情的一种重要依据。
很多传统的治疗方式只是将表面的一个疣体去除了，根本没能把病毒的清除，尖锐湿疣不但不易治好，而且存在着因反复发作而致癌的可能性。需要做清除皮肤真皮层和皮肤粘膜中的湿疣病毒，才能够治得好不复发。一般来说，尖锐湿疣复发最常出现于治疗后3个月内，随着时间的延长，病人传染性下降，复发的可能性亦下降。患者经治疗后6个月不复发，就算临床治得好了。
