在首次感染后也可能会有类似流感的症状，包括发热和腹股沟淋巴肿大。症状的来去没有特定的模式。有的人可能一年发作一次，还有些人可能几个星期就发作一次。在突发之前，可能会感觉到感染区域的疼，痒，发麻以及灼热感，还可能感觉到骨盆或下沿到腿的锐痛。
其症状表现为细小淡红色小疙瘩，大小不一，呈现单个或群集分布，湿润柔軟，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，红色或污灰色，根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易流血。生殖器疱疹患者皮损裂缝间，常有脓性分泌物郁积其中，致有恶臭，且每因搔抓而引起继发感染。由于不断受到局部湿润与慢性激发的作用，往往迅速增长。
