正常情况是不会说发生胚胎停育的，除非说之前下面一些情况:
1.染色体异常
这是一个不可能解决得了的原因，只要试管婴儿胚胎染色存在异常，那就不能完全将染色体恢复正常，只能尽量再去选择新的胚胎。如果将这个染色体异常的胚胎移植，那生育出来的婴儿也会先天性缺陷疾病。
2.生殖内分泌
胚胎移植到女性子宫腔后，需要三个重要的激素水平：一个是雌激素，一个是孕激素，一个是绒毛·膜促性腺激素，如果女性机体内分泌激素不够，胚胎也就失去了生长所需的营养，胚胎就会停止发育。
3.子宫问题
子宫是胚胎生长发育的地方，先天性发育不良、子宫畸形、子宫肌瘤及子宫内膜厚度等都会导致胚胎停止发育。
4.多囊卵巢
多囊卵巢综合症患者表现为内分泌紊乱、激素系统失衡导致的问题。高浓度的促黄体生成素，雄激素过高导致子宫内膜容受性降低，胚胎的发育环境发生改变，进而导致胚胎停止发育。
5.环境因素
接触了一些有毒的物质会影响到胚胎发育。或者是受到放射线或大量电磁辐射的照射。在孕期照射X光片等，接受了大量的放射线照射;微波炉等家用电器的辐射。另外，手机辐射、电脑辐射等也应引起格外注意。
6.心理因素
试管婴儿手术非常重要，关系到下一代。所以，女性的心理压力会很大，紧张、情绪不稳定等现象都会出现，心理压力较重的女性，血管长期处在收缩状态，影响了子宫、卵巢局部的血流，而且神经系统的紧张会使一些神经介质释放出现异常，造成子宫、输卵管肌肉收缩紊乱，胚胎不能着床或影响已经着床的胚胎发育。
7.药物因素
胚胎发育期间，还服用了其它的药物，这些药物对胚胎的发育有着非常至关重要的影响。这就会影响到胚胎的发育，甚至是停止、死亡。
8、封闭性抗体导致胚胎停育。
