治疗新生儿单纯疱疹病毒感染药物用阿昔洛韦可降低50%的死亡率，增加10%~50%的正常发育婴儿，阿昔洛韦的剂量为30mg(kg.d)，加入一般静脉输液中，分剂每8小时给药1次，共用10~14日。需要积极的支持治疗，包括适宜的静脉输液，营养，呼吸支持，纠正异常的凝血反应和控制惊厥，疱疹性角膜结膜炎需要全身性使用，阿昔洛韦和同时使用局部治疗如氟尿苷。 如前所述，认为对全身性单纯疱疹病毒感染的有效药物有两种，一是阿糖腺苷，一是acyclovir。从理论上干扰素也可能有效，但尚缺乏临床应用的报告。 关于阿糖腺苷，有人（Whitley，1980）曾试用于31例新生儿单纯疱疹病毒感染，并输液时间不少于12小时。结果：全身播散性患儿：治疗组8/14（57%）病死，对照组11/13（85%）病死。幸存者中，治疗组4/6有后遗症（1例有痉挛，2例有小头、癫痫发作
、痉挛、失明，1例有严重脑损伤及尿崩症），对照组中1/2有后遗症（小头、癫痫发作、失明、耳聋）。故总的看来此型的预后不好。但中枢神经系统感染型则不同，病死率治疗组仅1/10，而对照组则为3/6；后遗症治疗组为4/9（小头、癫痫发作、痉挛及失明），对照组2/3（1例偏瘫，1例小头、痉挛）。如将两型合并计算，则治疗组有7/24（29%）小儿健在，对照组仅2/19（11%）。提示，阿糖腺苷治疗确有一定好处。至于单纯疱疹型，治疗组似亦较对照组为优，两组虽均无病死者，但对照组8例中有3例，其皮肤、粘膜疱疹恢复后1年内却发生了脉络膜视网膜炎和/或神经系统损害，其中2例发展至痉挛和失明，1例发展为小并没有及痉挛。眼中未分离到病毒，也一直没有中枢神经系统感染的临床表现或脑脊液异常。提示有些单纯疱疹性中枢神经系统感染可能是亚临床型的，这些病儿以后仍可能发生神经系统损害和智力障碍，值得注意。单纯疱疹型治疗组有4例，均健在，仅1例于2岁时发生了轻度的脉络膜视网膜炎。提示，即使是单纯疱疹型患儿似亦值得进行阿糖腺苷的治疗。在整个治疗过程中，作者未观察到像成人治疗过程中的那些胃肠道及神经系统毒性反应，也未见到对骨髓、肝、肾功能的影响，血红蛋白、白细胞、肌酐、尿素氮也均与对照组同。其他报告也均证实阿糖腺苷对疱疹病毒感染有较好的治疗作用，如有人（Whitley，1981)两次报告本药单纯疱疹性脑炎的效果，第一次18例，第二次75例，诊断均经脑活检病毒分离证实。治疗后1月的病死率分别为28%及33%，而对照组为70%。治疗组共存活56例，其中30例正常。16例有中度后遗症，10例有严重后遗症。 亦有人报告阿糖黄嘌呤核苷（hypoxanthinearaleinoside,ARA-R）疗效与阿糖腺苷相似，剂量也一样，而毒性较少。 关于无环鸟苷（acyclovir）目前虽未见到对先天性单纯疱疹感染疗效的报道，便对有免疫缺陷病人单纯疱疹病毒感染疗效的报道提示此药还是有希望的，如有人曾对心脏移植伴有单纯疱疹病毒感染的病人进行过对照观察，药物剂量为250mg/m2，每8小时静脉点滴一次，点滴时间为1小时，共用7天，结果，病毒均于治疗后5日内消失，病变也迅速好转，与对照组有明显差异。作者并对血清药物进行浓度测定，发现血清药物浓度高峰为4.8～40.1μm，远远超过对单纯疱疹病毒Ⅰ型及Ⅱ型的50%抑制尝试（分别为0.1及1.0μm）。也有人认为，此药还可用于单纯疱疹复发的预防。如有人对抗-HSV阳性的骨髓移植病人进行观察，10例于移植前3日开始给药，剂量及给药方法同上，共给药18日，另10例为对照。结果给药组无1例有疱疹感染，对照组则有7例。也有人报告用5%的Acyclovir油膏涂抹，对生殖器疱疹有治疗作用，可使排毒期缩短。 以上材料均提示，此药值得试用于先天性单纯疱疹的治疗。由于此药毒性很小（偶有报告可引起肾功能减退者），因此，是否可用于预防亦值得研究。例如，对于单纯疱疹病毒阳性的孕妇是否可用此药治疗（全身和/或局部），以使分娩时病毒阴转，从而避免剖腹产。 发现有耐无环鸟苷的HSV毒株，主要是脱氧胸苷激酶阴性（TK-）株，但较少见。对耐药菌株可采取联合用药，如无环鸟苷和阿糖腺苷或疱疹净联合，亦有人主张无环鸟苷并用静注免疫球蛋白（IVIG）者。
