黄热病疫苗不良反应：
在免疫接种后5至7天在少数受试验者中发生自身限制的轻度局部反应（头痛,头痛和发烧,以及无症状发烧）.虽然在一项研究中以前接种的受试验者中较低不良反应发生率表明这些反应实际存在,但是在发表的所有报告中缺乏无效对照剂对照使对不良反应数据的解释不可信赖.婴儿中的反应原性并不高于并且甚至可能低于成人；在开展日常监测的受试验者中,发现更为经常的不良反应发生；有10%发生头痛和30%出现任何类型的反应.通过电话调查随访的370名旅行者中,25%的受接种者报告一种或多种反应,普遍较轻,特点是全身性流感样症状（22%）或局部反应（5%,通常为疼痛）（Pivetaud等,1986）.
严重不良事件
接种后脑炎
鼠和猴的大脑内接种以及在人中间发生罕见接种后脑炎病例显示,17D疫苗保留一定程度的神经毒力.这些病例主要但不全部发生在非常小的婴儿中.在1952年至1960年在婴儿中使用疫苗尚无年龄限制时,共发生15例.其中13例（87%）发生在4个月以下婴儿中,并且全部为年龄7个月或更小的婴儿.根据提供分母数据的两份报告,很小婴儿中接种后脑炎发病率可估计为千分之0.5至4.相比之下,在年龄大于9个月（目前建议常规免疫的最低年龄）的人中患脑炎的风险极低.在旅行者中只报告了3例此类病例.对不良反应的监测是被动和不敏感的.需要在大规模接种运动中进一步研究以澄清17D疫苗接种后脑炎的风险.
巴西最近报告了黄热病疫苗接种后2例死亡,其重要性尚不清楚.未发生毒力遗传突变（Silva,2000）.
对卵蛋白的直接变应性反应
生活护理：
目前的黄热病疫苗包含卵蛋白,并且在很少情况下可诱发直接变应性反应,包括过敏症.对有过敏史的242人经皮内接种0.1毫升17D疫苗.如在45分钟内未发生反应,他们再经皮下接种剩余的0.4毫升.9名受试验者（3.7%）发生变应性反应.已知蛰伏变态反应加重-4名患者中湿疹,哮喘,鼻炎,3名患者中荨麻疹以及另3名患者中“血清病样疾病”.在没有变态反应史的465人对照组中,只有3人对黄热病疫苗产生迟发反应（Kouvenaar,1953）.
主要由于以往对卵或卵基质疫苗的不耐性或变态反应史被认为是使用17D疫苗的禁忌,关于变应性反应发生率的较近期确切数据很少.根据对1990年至1995年间收集的数据进行初步评估（CDC,1990）,变应性反应的估计发生率为每百万份疫苗5至20例.其它成份也可能造成对疫苗的超敏感性,例如某些生产厂家作为稳定剂纳入的水解明胶（Monath,1999）.对于摄入蛋类后有全身性过敏症状史（全身性荨麻疹,低血压和/或上,下气道阻塞表现）的人,建议在接种前进行黄热病疫苗的皮肤试验.