(1)治疗肥胖：近年来日本对本品治疗肥胖症进行了大量的研究，表明本品对妇女肥胖确有疗效，尤其是对20~30岁妇女肥胖效果最为显著。方法是取防风通圣丸每次6克，每日6次，连服3~6个月，一般体重均有明显减轻。
(2)治疗脑病后遗症头痛，流行性脑脊髓膜炎、乙型脑炎、结核性脑膜炎及脑血栓等脑病：其急性脑症状经对症治疗缓解后，大多会留下前额或脑的某一部位疼痛。在各种治疗不获显效时，可用此丸，每次6克，每日口服3次，温开水送服。一般可在用药3～4日后明显好转。
(3)治疗多发性疖病：临床上可用防风通圣丸9克吞服，每日3次。体质强壮或疖头较多者，可改为汤剂，每日l剂，5天为一疗程。停药5天，再服下一疗程。3～5个疗程后，可控制疖病续发。
(4)治疗胆囊炎疼痛，慢性胆囊炎常急性发作疼痛：因胆石所致的疼痛就更为剧烈。此时，可急服防风通圣丸15克，以后每日2次，每次10克，常在出现轻微腹泻后，疼痛缓解。而且，因胆囊炎所致的发寒作热、胸闷呃逆亦随之消除。但是，对胆石嵌顿所致的化脓性胆系疾病，丸剂无效，可改汤剂试之。
(5)治疗荨麻疹：本病是一种常见的过敏性皮肤病，防风通圣丸对于风热犯表，如疹块色红，灼热瘙痒，伴有发热恶寒，遇热则皮疹加重，大便干燥，小便短赤，舌红苔黄者，有很好的疗效。每次口服6克，日服2次，温开水送服。
(6)治疗急性化脓性中耳炎：本病多属外感风热，郁而化火，邪毒循经窜络于耳所致，可选用防风通圣丸治疗，用法是取本品内服，每次6克，每日2次。
(7)治疗脑病后遗症 ：对流脑、乙脑、结核性脑膜炎及脑血栓等病经对症治疗缓解后，多数留有前额或某一部位疼痛的后遗症，在各种药物治疗不见效时，可服防风通圣丸治疗，每次6克，每日1次，一般在3~4天即可见效。
(8)治疗慢性阑尾炎：先以防风通圣丸原方水煎服，每日1剂，分2次服用，以急取效，待症状缓解后用本品丸剂内服，每次6克，每日2次，具有较好疗效。
(9)治疗高血压：防风通圣丸内服，每次6克，每日2次，治疗高血压有较好疗效，若是病情较重，可用本品原方改为汤剂水煎服，一般连服15天以上即可见效，血压可下降2.67kPa。
(10)治疗斑秃：方法是将防风通圣散原方加少量白酒浸1夜，焙于研为细未，每次6克，每日2次，开水冲服，另以白酒500克浸半夏60克，浸液涂搽患处，每日早晚各1次。
(11)治疗扁平疣：每次服10克，每日2次，温开水送服。1周为1疗程，一般1~3疗程见效。通常服用3~7天后，自觉皮损部位有紧张感和微痒痛，丘疹增大，发红，继而脱落消失。治疗此病，剂量可视患者体质而酌情增减；体质较差，食少便溏者，每次可服3~6克。服用时可能出现轻微腹泻，此属正常现象，一周内自止。
(12)治疗春季结膜炎：成人每次服用9克，每日2次；不足16岁者每次服用6克，不足10岁者每次服用3~5克，同样是每日2次。一般7天后自觉症状消失，20天基本痊愈。
注意：孕妇禁用；本品攻下力较强，不宜久服，以免损伤中气，体弱便溏者慎用；应用本品治疗期间，饮食易清淡，忌食辛辣，油腻食品。
