胃肠道的屏障功能包括:机械屏障、生物屏障、化学屏障和免疫屏障共4方面。与成人相比较,小儿尤其是新生儿、婴幼儿消化系统的解剖和功能尚未发育健全,因此小儿胃肠道的运动、分泌、消化、吸收和免疫功能均与成年人有所不同,肠道屏障功能不成熟,容易出现病原微生物和过敏原的渗漏现象。生物屏障主要指肠道正常菌群对人体的保护作用,小儿出生前肠道并无细菌存在,出生后细菌很快进入胃肠道,主要来自分娩过程、母乳喂养以及周围环境,早产儿、剖宫产儿以及较早使用过抗生素的小儿肠道微生物群建立延迟、组成异常,可影响到其肠道免疫功能。