神经系统能接受刺激并将刺激转变为神经冲动进行传导，以调 节有机体各器官的活动，保持各器官之间以及机体与外界环境间的 平衡和协调一致，以维持机体正常的生命活动。一旦神经系统发生异常，立即引起平衡失调，蝎子的生理活动就会异常。蝎子的神经 系统由脑、腹神经索、腹神经节及其分支神经组成。
  脑包括脑神经节和咽下神经节，以及连接脑神经节和咽下神经 节的咽神经。脑神经节又称咽上神经节，不发达，呈双叶形，位于 食道的背面，分支到触肢和步足。由脑神经节分出一对神经纤维，绕过食道形成围咽神经，并和咽下神经和腹神经索相连。腹神经索 呈索状，是由咽下神经节向后伸出的纵神经，具有7个腹神经节， 即腹部的每个体节上都有一个腹神经节。
  每个腹神经节又分支出神经到本体节。蝎子这种神经系统的整体似索状，故称索式神经。另 外，从脑神经还分支出许多分支神经，分别到达眼、栉状器、附肢和生殖厣等处。总之，神经纵贯全身，协调全身的活动。另外，在脑的神经节以及腹神经节中，往往集中了成丛的神经 分泌细胞，它无特殊的导管，其分泌物直接进入血液中，属于内分 泌激素。
  这种激素与蝎子的蜕皮生长，以及生殖细胞的成熟有关，也与蝎子的发情、交配等行为有关。感觉器官为感觉神经末梢的特殊结构，能分别接受体内、外环 境中的某种特殊刺激，并能将其转变为神经冲动，沿传人神经传到 中枢而产生相应的感觉，从而使蝎子对环境的各种信息作出必要的利于自身生存、机警敏捷的反应。
  蝎子的感觉器官有眼、栉状器以 及身上的神经的“毛”。蝎子有1对中眼和3对侧眼，其中中眼比侧眼发达，但它们都是单眼。每个单眼由角质晶体、表皮层、杆状细胞和网状细胞所构 成。单眼的视力很差，一般只能在很短距离内识别交配中的配偶或近身旁活动的小动物，基本上没有搜寻、跟踪、追捕食物的能力。
   单眼有敏感的感光能力，蝎子靠单眼能感知光线的强弱，对强烈的刺激性大的强光避而远之，而对弱光却往往又有趋向的行为。蝎子全身表面遍布触毛，在附肢表面最多，这种毛基膨大形成 球状，里面有很多感觉细胞，只要它们受到刺激就很快产生冲动， 传入神经中枢，然后神经中枢发出“命令”，调控蝎子的行动。
  由于感觉细胞不同，毛的感觉功能有所区别，如专门感觉触角的触 毛，靠触毛可以识别地面的震动、爬走在路上的异物等。还有专门的听觉感受器——听毛，着生在步足上，它可以接受气流和低频率 的空气振动，所以能感知外界环境中的各种噪声，并且立即逃避躲藏。还有味觉感受器——味毛，它位于步足的末端和触肢上，蝎子 接触到小动物时，能嗅出小动物是死是活，一旦嗅出死的动物时，往往拒绝捕食。
  
  蝎子也能嗅出外界环境中的各种有害气味如农药、 酒味等而逃走。蝎子交配时，公蝎能够嗅到母蝎散发出的清香一性诱集素，而前往与母蝎交配。此外，在蝎子的外骨骼还有感知和 传递机械压力的信息，为蝎子选择蝎窝、向前或向下爬走起决定性的作用。蝎子腹部的栉状器中也布满了神经末梢和感觉细胞，也是特殊 感觉器官，有感觉维持身体平衡和感知异性的功能，在母蝎交配时 栉状器在传递精荚时起到决定性的作用。