目前的医学水平还没有治疗肾囊肿的特效方法对于小的肾囊肿、无症状时不需要做任何治疗、但要定期复查、观察囊肿是否继续增大无症状者应经常进行尿液检查、包括尿常规、尿培养、每半年至一年进行一次肾功能检查、包括内生肌酐清除率由于感染是本病恶化的重要原因、所以若非十分必要、不要进行尿路创伤性检查肾囊肿穿刺作用不大、不仅易于感染、易于复发、而且经过长期观察、该术也不能延缓肾功能损坏的发生手术切除囊肿也不是一件容易的事、因为肾表面的囊肿可以切掉、但要切掉埋在肾脏深部的囊肿就相当困难肿物较大且有恶变可能时、可以进行手术探查、如果证实为良性囊肿、可将肾表面的囊壁切除、边缘用肠线与肾实质连续缝合、残留囊壁涂以碘酊一侧肾实质广泛破坏、对侧肾功能正常者、可行肾切除术
