一直没搞懂我们总公司（目前下属连锁店均为分公司性质）与各连锁店之间的财务关系该如何理顺。 一、与分公司的关系。 1、资金如何调拔？ 现在所设分公司性质的店，我们是以直接投资方式进行，各种成本也计在总公司的帐上，在分公司开始营利后（税收是交到连锁店所在省了）财务总监却跟我说不知道资金如何从分公司调回来总部？说涉及税收问题太复杂？请问这个理由成立吗？有多麻烦？ 2、货物流转？ 既然是连锁，很多货需要从总公司配给各连锁店（即分公司）本省还好，通过努力，搞成“汇总预缴”了，应该说在流转税上减少了很多压力。但实在没能力“协调”外省的税务局了，只得按“调货也当销售计算”来处理，好冤呀！能有办法解决吗？
如果分公司是非法人性质的，可以把流转税在分公司所在地缴纳，所得税回总公司所在地汇总缴纳（需要总公司所在地主管税务局出具证明给分公司所在地主管税务局）。 在增值税暂行条例实施细则中，视同销售的第三条：设有两个以上的机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送到其他机构用于销售（相关机构设在同一县、市的除外）。因此，总公司将货物移送到分公司 也就视同销售，需要缴纳增值税了。当然在分公司可以抵扣进项税的。
