中医认为，其病性早期属热证、实证，为湿热、毒火阻滞肝脉;后期则伴有肝肾不足。治疗主要是根据症状、体征，结合舌脉，一般将本病分为三型，即湿热下注、毒热蕴结、肾气不足，分别给予不同的治疗方法。详细检查、因人而异、结合临床、专业医生指导用药.
1.属于湿热下注证的生殖器疱疹，常见生殖器部位水疱成簇，周边有红晕，或有糜烂，有轻痒，可见小便黄赤，口苦，口渴，舌红苔黄腻，脉弦滑。这是由于素日喜肥甘厚味，辛辣之品，或嗜烟酒，损伤脾胃，脾失健运，水湿内蕴，郁而化热，湿热之邪下注肝经所致。湿热蕴积于下焦，注于阴部，发为生殖器疱疹。治疗法则宜清热除湿，方药常以龙胆泻肝汤加减：龙胆草山栀黄芩柴胡车前子(包)生地当归木通生甘草。方中龙胆草清泻肝经湿热;山栀、黄芩、柴胡配合龙胆草清肝利胆;车前子、木通清热利湿;生地、当归凉血活血;生甘草调和诸药。水疱大、糜烂渗液者，加生苡仁、茵陈、大便秘结者，加生大黄(后下)。
2.属于毒热蕴结证的生殖器疱疹，见阴部疱疹大而红，局部肿胀，疼痛明显，腹股沟淋巴结肿大，或有低热，排尿困难，舌红绛，脉滑数。这是由于不洁性交，外染淫毒，毒热结聚阴部，蕴结于局部皮肤粘膜所致。治疗法则宜清热解毒，常以方药为清毒神圣汤加减：金银花天花粉蒲公英当归生甘草板蓝根。方中金银花清热解毒为主药;天花粉排毒驱腐;蒲公英、板蓝根配合主药加强治疗作用;当归、生甘草养血活血，调和诸药。如小便黄赤，排尿疼痛困难者，加马鞭草，天葵子，淡竹叶，淋巴结肿大疼痛者，加地丁，夏枯草。
3.属于肾气不足证的生殖器疱疹，常见于复发性阴部疱疹，疱疹干涸较小，无自觉症状，但经常复发。这是由于肾气不足，淫毒之邪未尽所致。肾开窍于前后二阴，或由于房劳过度，或由于湿热、淫毒久稽，耗伤肾阴;日久阴损及阳，也可造成肾阳不足。肾阴肾阳是人体最宝贵的物质，统帅着人体全身的阴阳，当肾阴肾阳受损后，人体阴阳就会失调，疾病就容易复发。由于肾气不足故多伴有腰膝酸软，浑身乏力。阴虚者，则多有五心烦热，失眠多梦，遗精早泄，舌红少苔，脉象细数。肾阳不足者，则多有手足不温，少腹拘急，舌淡苔薄，脉象沉细。治疗法则以补肾为主，佐以解毒除湿。常用方药为六味地黄丸加减：生熟地,山药,山萸肉,枸杞子,茯苓,泽泻,丹皮,板蓝根。
方中生熟地滋补肾阴;山药、山萸肉、枸杞子滋补肝脾肾三阴;茯苓、泽泻、丹皮乃补中有泻;板蓝根清泻余毒。如阴虚火旺者，加女贞子，知母;肾阳不足者，加制附片，肉桂，仙灵脾。
阴虚内热，表现：殖器疱疹，反复发作，日久不愈，渗液较少。伴咽干唇燥，五心烦热。舌红绛，苔花剥，脉细数。可用中成药：①知柏地黄丸。②大补阴丸
事实证明，常用的一些中药外洗方或外治方，可以减轻生殖器疱疹的疼痛和症状，内治和外治结合起来可提高疗效。以下是常用的中药外洗方和外治方。
(1)马齿苋，野菊花，黄柏。
(2)木贼草，板蓝根.
(4)取鲜半边莲适量，洗净后捣如泥，敷于患处，盖上纱布。
(5)取青黛散适量，加入香油调成糊剂，用时涂于患处。
注：详细检查、因人而异、结合临床、专业医生指导用药.
