丘脑底部是丘脑与中脑被盖之间的过渡区，内侧和嘴侧是下 丘脑，腹侧和外侧界是中脑大脑脚和内囊。除红核和黑质的嘴侧 上达该区外，还包括了丘脑底核、未定带核底丘脑网状核团，以及经过该区底纤维束即红核前区（Forel - H区）、豆状袢和豆状 束（H2区）和丘脑束（H1区）。
丘脑底核（subthalamic nucleus, STN)又称Luys体，是丘脑 底部中的最主要核团，位于底丘脑和中脑的移行部，在冠状切面 上呈双凸镜形，位于乳头体背外侧，紧贴内囊后肢的内侧缘和大 脑脚底上部的背内侧面。STN的背内侧是豆状束的延续，即H2 区；此核的下部位于大脑脚底的背面，其后端伸至底丘脑与中脑 被盖的移行区，且与黑质的上端相延续，居黑质前端的背外侧。 丘脑底核的传入纤维来自大脑皮质（4、6区）、苍白球外侧部、 丘脑和网状结构，传出纤维投射至苍白球和黑质网状部。其中最 重要的是，丘脑底核发出兴奋性的谷氨酸能纤维投射至Gpi -SNr 复合体，Gpe则发出移植性GABA能纤维投射至丘脑底核。
未定带是一条灰质带，位于丘脑与豆状核之间，向外与丘脑 网状核相续。接受苍白球和大脑皮层运动前区的纤维，与丘脑板 内核群、红核及中脑被盖之间有密切的纤维联系。
红核前区（Forel-H区）又称Forel被盖区，此区的细胞称 为红核前区核。其纤维包括齿状核丘脑束、红核丘脑束和豆状 束，后者中止于红核前区核。由此核发出的纤维止于红核和中脑 网状结构。
豆状束（lenticular fasciculus)又称H1区，位于苍白球内侧 部的背侧，由苍白球背内侧发出的纤维组成，经丘脑底核的嘴侧 穿过内囊。在未定带的腹侧，此束比较明显，此束向尾侧与豆状 袢合并，形成红核前区。豆状袢（lenticular ansa)的纤维起自苍 白球腹侧，向腹内侧和嘴侧绕过内囊后脚，进入红核前区。丘脑 束又称H2区，位于丘脑的腹侧，由几束纤维组成。来自豆状束 的纤维，沿未定带的背侧面向背外侧，中止于丘脑腹前核和腹中 间核；另一部分纤维离开丘脑束，向背侧、尾侧核内侧，中止于 丘脑板内核群的中央中核；尚有来自小脑齿状核的纤维，经丘脑 束中止于丘脑腹中间核的嘴侧部，有的纤维中止于嘴侧的丘脑板 内核。
