免疫排斥人体免疫系统就像是自身的防御系统，对于外来侵略物，免疫系统会自动清除，而胚胎有一半是来源于父亲，竟然有可能受到妈妈免疫系统的排斥。但是在正常的免疫系统中，存在免疫耐受的机制，可以使胚胎在母亲体内健康地成长。如果免疫系统亢進，排斥外来物质能力提高，会导致胚胎受到排斥，导致自然流产。
反复流产有可能是在妊娠期间感染，无论是全身性的感染或是生殖泌尿系统局部感染，都可能导致妊娠丢失的结局。徐丽南介绍，在排除复发性流产的病因时，生殖道衣原体、支原体、分泌物检查就显得十分必要。如果确实有感染，进行针对性治疗后，再次怀孕时发生流产的几率可大大下降。
