怎么办呢？我的牙齿上面最里面两颗都坏掉了一部分？

如果牙齿坏的不严重，牙根还有保留的价值，当然做根管治疗是比较好的选择；因为这样保留了自己的牙齿，根管治疗后只要在上面做个牙套保护这颗牙齿就可以了，用起来会更舒服；如果将牙齿拔掉后，那就要镶牙，镶的再好的牙齿都是假牙，使用起来都比不上自己的牙齿的。

病情分析：
根据你的描述，龋坏的牙齿有时还疼，考虑有牙髓炎的症状，可以对症治疗
指导意见：
治疗可以做根管治疗后补牙，还可以用点头孢类抗生素和替硝唑消炎就可以了

这种情况是智齿冠周炎。建议：1、目前有肿痛症状，处于急性炎症期，应以消炎、镇痛治疗为主，可以口服螺旋霉素、甲硝唑及芬必得等抗炎对症治疗。2、如果经常反复发炎，建议到医院口腔科进行检查，拍牙片，了解智齿生长情况，如果牙位置不正无法萌出，则应尽早拔除，以防感染再发。3、注意口腔卫生，防止炎症发作。