1、免疫因素：免疫方面的问题通常是因为母体本身自体免疫所造成的，像红斑性狼疮、原发性血小板减少等这一类自体免疫患者，其流产率和胎儿死亡率都很高。Rh及ABO血型不合也可引起反复流产。
2、精液因素：有关研究显示，大约有10%一15%的男性精液中含有一定数量的细菌，可影响孕妇使胚胎流产。近来发现有一种无症状的菌精症可导致孕妇流产。因此怀孕前男方要做生殖系统的检查，有菌精症的要治疗彻底后再使女方怀孕。
3、染色体异常：由于夫妻一方染色体的数目或结构异常所致的胚胎发育不良，是流产常见的原因，特别是怀孕头3个月。对染色体异常所造成的习惯性流产，现在唯一的方法是让他们继续尝试直到成功为止或者考虑卵子或精子捐赠。4、外界不良因素的影响：大量饮酒、吸烟、接触化学性毒物、严重的噪音和震动、高温环境、情绪异常激动等，这一切可导致胎盘和胎儿损伤的因素都能够造成流产。对这类问题造成的流产的解决办法，就是要避免上述有害物质的刺激。
5、内分泌异常：一些常见的内分泌问题有可能是习惯性流产的原因，例如黄体机能不全、多囊性卵巢综合征、甲状腺功能异常、泌乳激素过高症。由于胚胎得不到激素的支持而流产。对于这些内分泌异常症状若能妥善治疗，怀孕成功的机会相当大。
6、子宫颈闭锁不全：这一类的患者流产发生的时间是在怀孕13周以后，典型的症状是先破水，再阵痛，发生流产时胎儿一般都还有心跳。目前最有效的治疗是孕前做宫颈内口修补术，如果已怀孕于妊娠14～16周做宫颈内口环扎术，分娩前拆除缝线。如果有流产征象要及时拆除缝线。
7、子宫异常：可以经由子宫造影及宫腔镜诊断，发现有先天(如双子宫、双角子宫、子宫中膈等)畸形，可以考虑手术治疗;后天的异常如子宫内粘连可行宫腔镜治疗。对于极少数因为子宫肌瘤引起习惯性流产的患者，肌瘤大者可以采用手术切除，小的则经官腔镜切除。
