卷一至卷四部分----“序例” 和“百病主治药”。 卷五至卷五十二部分----这是《本草纲目》的主要内容，它把所收录的1892药物细分为16部，部下又分类，总计60类,在大多数药物后面，都附有历代的经验药方11096个，其中有8160个是来自李时珍亲自收集。 《本草纲目》栏目，本数据库所收录《本草纲目》的版本是金陵版，依据主要是刘衡如的点校本。由于本书内容繁多，且重点又放在1892种药物的主治功能上；因而,本数据库只能着重选择原著中，按药物的“正名”、“释名”、“气味”、“主治”、“附方”等五部分组成字段名的数据库。以便读者搜寻、浏览和查询。这样，既为那些从事《本草纲目》的研究学者方便查询，同时也为普通读者方便搜集治病的药物。并为满足医疗临床、预防医学、养生保健、科研和教学等，提供准确、详实的材料；也为开发新药研究提供线索和工、农业生产提供指导和参考。 《本草图谱》栏目，共收录了1200多种药物的彩色图谱，按 现代科学分类法：类、科、种进行分类，以方便查询和浏览。同时克服了《本草纲目》中没有彩色图谱的缺点。 《中药验方》栏目，共收录了500多个常用药膳验方,并且在下一版本会不断地充实、增加内容。 《中药图谱》栏目，共收录了500多种常用中药材图谱及临床用途，基于中医院校《中药学》，可供基层中医药工作者参考。
